по мотивам Как создать мультизагрузочную флешку содержащую несколько операционных систем и ещё программы
Скачиваем WinSetupFromUSB с официального сайта.

Для пустой флешки

В главном окне программы WinSetupFromUSB отображено название нашей подсоединённой флешки. Ставим галочку на пункте Auto format it with FBinst и отмечаем пункт NTFS. Отмечаем галочкой пункт Linux ISO/Other Grub4dos compatible ISO!

Если флешка уже содержит образы

Если ваша флешка уже загрузочная и вы к примеру залили на неё операционные системы с помощью программы WinSetupFromUSB, значит пункт Auto format it with FBinst не отмечаем и сразу переходим к пункту Linux ISO/Other Grub4dos compatible ISO и нажимаем на кнопку справа,

Удалить образ — http://www.winsetupfromusb.com/faq/ вопрос 15.
Редактировать пункт bootmenu — http://www.winsetupfromusb.com/faq/ вопрос 16.
Написано автором.